Из-за возникших разногласий Фред, Дафна, Велма, Шегги и дог Скуби-Ду принимают решение о роспуске своей «Тайной корпорации». Спустя некоторое время каждого из них по отдельности приглашает на Зловещий остров некто Эмиль Мондавариус. Он просит детективов расследовать тайну странного поведения студентов, подозревая, что в деле не обошлось без чудовищ. Чтобы спасти невинных людей, бывшим друзьям придется снова найти общий язык.
Через два года после распада Тайной корпорации, основатели группы друзей - Скуби-Ду, Фред, Дафна, Шэгги и Велма, получают приглашение на Зловещий остров. Владелец острова, Эмиль Мондавариус, напуган серией паранормальных явлений, которые происходят во время Спринг-Брейк, опасаясь, что это может испортить репутацию его курорта.
Друзья понимают, что им придется вновь объединиться и преодолеть свои личные разногласия, чтобы разгадать новую загадку. Они отправляются на остров, где сталкиваются с необъяснимыми явлениями, которые выглядят очень реальными. В процессе расследования им предстоит перемыслить новые инциденты и события прошлого, а также встретиться с мнимыми вампирами и привидениями.
Таким образом, друзья вновь оказываются в центре событий, готовые принять вызов и раскрыть сверхъестественные тайны, чтобы спасти как самих себя, так и всех отдыхающих на острове.